Δυστυχώς, μέχρι σήμερα πολλά από τα τμήματα του Πανεπιστημίου Αιγαίου παραμένουν με ελλιπή στελέχωση μελών ΔΕΠ και με ελλιπείς εγκαταστάσεις, τόσο για τη διεξαγωγή των μαθημάτων, όσο και για τη διαμονή και την αξιοπρεπή διαβίωση των φοιτητών που αποφασίζουν να σπουδάσουν σε ένα ακριτικό νησί. Ένα μεγάλο μέρος των διδακτικών αναγκών καλύπτονταν μέχρι τώρα με συμβασιούχους διδάσκοντες, ειδικότερα στο τμήμα Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής της Λήμνου που οι συμβασιούχοι είναι περισσότεροι από τα μέλη ΔΕΠ, οι οποίοι είτε αναγκάζονταν να εγκατασταθούν σε ένα από τα νησιά μας (αντιμετωπίζοντας προβλήματα όπως καθυστερημένες πληρωμές, ακριβή διαβίωση και πολλά άλλα), είτε αναγκάζονταν να μετακινούνται συνεχώς (με επίσης δυσβάσταχτο κόστος, λαμβάνοντας υπόψη τα προβλήματα των συγκοινωνιών σε πολλά νησιά).
Για φέτος, και ενώ το νέο ακαδημαϊκό έτος έχει ήδη ξεκινήσει, το Υπουργείο Παιδείας έχει δηλώσει ότι δε θα χορηγήσει καμία πίστωση για συμβασιούχους διδάσκοντες. Το ερώτημα που τίθεται είναι πώς είναι δυνατό να διεξαχθεί ομαλά η παρεχόμενη εκπαίδευση, λαμβάνοντας υπόψη τις τρομερές ελλείψεις προσωπικού σε πολλά τμήματα;
Από την άλλη μεριά ¨διαρροές” (ή έστω διαρροές) του διαβόητου προγράμματος “Αθηνά”, το οποίο αναμένεται να σαρώσει και να καταρρακώσει την τριτοβάθμια εκπαίδευση, υποστηρίζουν ότι πολλά από τα τμήματα του Πανεπιστημίου Αιγαίου θα κλείσουν ή ενδεχομένως και θα συγχωνευθούν με άλλα τμήματα, άλλων Πανεπιστημίων. Το ερώτημα που τίθεται είναι πώς και κατά πόσο η η πολιτεία υποστηρίζει την περιφερειακή ανάπτυξη και μάλιστα σε περιοχές της χώρας μας οι οποίες σαφώς και μπορούν να θεωρηθούν ως νευραλγικής σημασίας, τόσο για εθνικούς λόγους, όσο και για οικονομικούς λόγους (μέσω της ανάπτυξης του τουρισμού);"
