Η απογραφή διενεργείται το διάστημα των μηνών Νοεμβρίου-Δεκεμβρίου κάθε έτους και η κοινοποίησή της στην αρμόδια κτηνιατρική αρχή εκτελείται εντός προθεσμίας 30 ημερών από τη διενέργειά της που πάντως δεν ξεπερνά την 15η Δεκεμβρίου.
Οι κτηνοτρόφοι ή/και οι γραμματείς των τοπικών Αγροτικών Συνεταιρισμών οφείλουν να προσέλθουν στο Τμήμα Κτηνιατρικής Λήμνου για την διενέργεια της Απογραφής Ζωικού Κεφαλαίου, προσκομίζοντας απαραιτήτως το «Μητρώο Εκμετάλλευσης Αιγοπροβάτων» τους, συμπληρωμένο με τις τελευταίες μεταβολές στο ζωικό κεφάλαιό τους (επικαιροποιημένο) με την δική τους ευθύνη.